Program Kerja Kesiswaan MAN 2 Mojokerto memberikan kebutuhan siswa-siswi sebagai capaian prestasi, organisasi, serta pengembangan karakter melalui pembinaan-pembinaan terpadu.
Progam Kesiswaan meliputi :
Pembinaan Karakter Agama
Meningkatkan mutu karakter Agama sebagai ciri khas Madrasah melalui Sholat Berjamaah, Peringatan PHBI, Lomba bernuansa keagamaan, Istighosah, Tadarrus Al-Qur’an, Khotmil Qur’an dan Pendalaman Kitab Kuning
Pembinaan Budi Pekerti Luhur
Menanamkan karakter berbudi pekerti luhur melalui implementasi tata tertib dan kultur sekolah, menjaga kebersihan kelas dan lingkungan, bakti sosial, infaq mingguan, penyaluran daging qurban, dan penyaluran zakat.
Pembinaan kepribadian kebangsaan dan bela Negara
Menanamkan pribadi kebangsaan dan bela Negara melalui Upacara rutin dan PHBN, persami dan karakter pramuka, serta membudayakan pembelajaran nilai sejarah dan kearifan lokal.
Pembinaan prestasi akademik,seni dan olah raga
Pembinaan Pendidikan politik dan sosial
Pembinaan kreativitas, ketrampilan dan kewirausahaan
Pembinaan kualitas jasmani, kesehatan dan gizi
Ektsrakurikuler MAN 2 Mojokerto meliputi :
Atletik
Bola volly
Pencak silat
Drum band
Pramuka
PMR
BTQ
Tahfidz
KIR
Bahasa Inggris
Karate
Taekwondo
Basket
Badminton
Catur
Paskibraka
Pecinta Alam
Pengembangan kesiswaan meliputi :
Lomba Rumpun Mata Pelajaran
Lomba Keagamaan
Lomba Karya Tulis Ilmiah Remaja
Lomba Cabang Olah Raga
Ikatan Alumni